经过三十多年发展，东南大学工程管理学科已经形成了有特色的完整的培养和教育体系。培养既懂工程，更精管理，工为基础、工管结合，管为核心，具有专业核心能力的符合创新型人才。在本科阶段就采取了导师制培养，精英式教育的培养模式。

在专业教育方面，第一，创建形成了“一体两翼”的专业核心能力，通过整合、重构工程管理专业课程体系，创建形成了以工程技术和信息技术为基础，以工程项目管理能力为主体，以工程造价管理能力和合同管理能力为两翼支撑的“一体两翼”型核心能力结构，用现代信息化BIM技术、工程管理软件平台及工具，创建形成以现代土木工程为对象，以“1书（工程价格计算书）+1图（工程网络计划图）+2方案（工程项目管理方案和合同管理方案）”为特征构成的核心能力显性化、可视化、标准化表现形式和内容，通过课程模块化和结构化，形成核心能力导向型的多学科、模块化、结构化工程管理课程群。第二，实施了面向核心能力培养的教学新模式，构建“开放式、引导型、研讨型”人才培养的教学新模式，建立国家级工程实践教育中心等校企联合体，构建工程管理优质实践和训练平台；充分运用工程管理信息化试验室，开展课程设计和毕业设计；强调与企业实质性深度合作，建立多家企业校外实践创新教学基地，加强实践能力培养；通过优化课程体系，提高学生研讨能力，提高学生科研创新能力。第三，形成了高水平学术科研反哺专业课程教学的模式。在全体师生的共同努力下，获得多项国家自然科学基金、国家社会科学基金项目、教育部人文社科基金项目等。这些高水平学术科研项目为工程管理专业的所有课程提供优质教学资源，部分教师将承担科研项目细化为适合本科生开展的学术问题，指导工程管理专业学生通过SRTP的形式开展学术研究，实现理论与实践相结合、科学研究与人才培养相结合，提升了工程管理专业学生的培养质量。